张岩教授课题组在超级增强子研究的新资源取得重要进展
2019年10月31日《Nucleic Acids Research》(IF 11.147)在线发表了beat365在线唯一官网登录张岩教授课题组的新成果《SEA version 3.0:a comprehensive extension and update of the Super-Enhancer》。超级增强子(Super-enhancer,SE)是基因组中大量增强子富集的转录调控区域,能够大幅度地激活基因的表达,且具有较高的组织特异性,在发育、肿瘤等过程中均扮演着重要的角色。为了推动超级增强子相关研究的进展和深入,课题组开发了最新版本的超级增强子数据库SEAv.3.0(http://sea.edbc.org),集超级增强子查询,下载,可视化,分析于一体的综合平台,提供标准查询、基因组浏览器、个性化分析工具和SEs数据下载。数据库存储了11个物种164,545个超级增强子(人,小鼠,果蝇,线虫,斑马鱼,鸡,黑猩猩,恒河猴,绵羊,非洲爪蟾和棘背鱼)以及3,361,785个典型增强子。同时提供超级增强子区域的染色质相互作用、SNPs、转录因子结合位点和SpCas9靶位点的信息。嵌入基于香农熵的工
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